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实验介绍
【实验介绍】
Co-IP主要用于检测蛋白质与蛋白质之间相互作用,是IP实验的一种扩展, 基于IP反应的潜力,在样品溶液中捕获和纯化主要目标(抗原等)及通过天然相互作用靶标结合的其他的大分子。此外,还可以利用Co-IP来确定在不同条件下的蛋白质相互作用。
CO-IP的应用场景主要是:
1、用于研究蛋白质复合体成分(通过IP级抗体直接捕获目的蛋白族群,或通过构建带标签的目的蛋白融合表达载体并通过标签蛋白的IP抗体进行免疫捕获。常与western blot和蛋白质谱联用进行IP产物分析)。
2、用于检测生理状态下存在的蛋白质互作关系。
3、 用于检测蛋白质的修饰状态,如泛素化。
【技术原理】
免疫共沉淀是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的Protein G或A能特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的方法。其基本原理是在细胞裂解液中加入感兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于磁珠的Protein G或A,若细胞中存在与兴趣蛋白相结合的目的蛋白,就可以形成蛋白复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—Protein G或A”;最后通过免疫印迹实验来检测目的蛋白。
【实验流程】
案例展示
技术总结
【技术总结】
1、实验样品制备方法准备:很重要!根据研究目的,检测样品可能是组织样品,也可能是细胞样品,不同样品制备流程不太相同,目的蛋白表达量也有较大差别,必须选择合适的样品和样品制备方法。
2、根据研究目的选择适合的蛋白特异性抗体:非常重要!用于Co-IP实验的抗体是针对目的蛋白的特异性抗体,最理想的是选择一种能识别兴趣蛋白质某个表位的抗体,且这个表位不会被任何其他蛋白质相互作用所掩盖,比普通WB抗体要求高出很多;同时,抗体特异性和灵敏性尽可能高,才有可能有干净的背景和较好的IP效果,所以必须选择最适合的抗体用于Co-IP实验。
【注意事项】
1、细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用,多采用非离子变性剂(NP-40 或 Triton- X-100)。每种细胞的裂解条件是不一样的,通过经验确定;
2、不能用高浓度的变性剂(0.2%SDS),细胞裂解液中要加各种酶抑制剂;
3、使用对照抗体:单克隆抗体:正常小鼠的 IgG 或另一类单抗;兔多克隆抗体:正常兔 IgG;
4、确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白,单克隆抗体的使用有助于避免污染的发生;
5、要确保抗体的特异性,即在不表达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀;
6、确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中,而不是由于细胞的溶解才发生的,这需要进行蛋白质的定位来确定。
送检与交付标准
样品类型 | 样品需求 | 保存条件 | 运输条件 | 备注 |
---|---|---|---|---|
动物组织 | 单个样品>0.1g,2mlEP管或冻存管装,不要过量;样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低,冻存样本避免反复冻融以致降解 | -80℃ | 干冰 | 所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识 |
种子样本 | 去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 | |
贴壁/悬浮细胞 | 1. 总RNA或蛋白:106cell/指标、浆/核RNA或蛋白:107cell/指标、线粒体RNA或蛋白:2*107 cell/指标,样本尽量新鲜,细胞收取后直接加Trizol(QPCR检测)或直接冻存于-80℃ 2. 若细胞处理(加药、转染、感染)后状态差应酌情加大收样量 | -80℃ | 干冰 | |
全血/血清样品 | 用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白细胞匀浆>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。 | -80℃ | 干冰 | |
石蜡包埋样品 | 由标准的石蜡包埋盒包埋的石蜡块,有效厚度大于 0.1cm; 新鲜的 FFPE 组织切片,每片厚度不超过 10μm,2~8 张,表面积不超过 250mm2。 | -20℃ | 冰袋 | |
抗体 | 1. 按样本种属提供满足相应实验要求的抗体; 2. 按抗体说明书要求寄送,尽量避免分装;如分装,确保量足够进行实验,并提供抗体说明书。 3.保存抗体的抗体管上应有能够识别此抗体的标记,抗体的量应大于实验所需的量。 | -20℃ | 冰袋 | |
引物 | 干粉,≥1OD,如进行预实验,每个基因至少提供两对引物, 附带公司引物合成单。 | -20℃ | 冰袋或常温 |