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实验介绍
【技术原理】
GST pulldown实验是一个有效验证酵母双杂交系统的体外试验技术。
基本原理:将靶蛋白-GST 融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物通过 SDS-PAGE 电泳分离,最后经western blot或质谱分析,从而证实两种蛋白间的相互作用;
1. 确定某一个蛋白质与另一个蛋白质的直接作用关系。
2. 筛选某一个蛋白质直接结合的蛋白质族群。
3. 验证酵母双杂交系统结果的有效性。
【技术原理图】
案例展示
优势与不足
优势:
1. 区别于CoIP,GST pull down技术可以明确两个蛋白质之间是否直接作用。
2. 可用于筛选与目的蛋白质直接结合的蛋白质族群。
3. 可联合酵母双杂交系统综合评估蛋白质之间的相互作用关系,是一个有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术。
不足:
1. 体外表达的重组蛋白,无法完全模拟特定生理状态下的蛋白质活性及结合情况。
送检与交付标准
样品类型 | 样品需求 | 保存条件 | 运输条件 | 备注 |
---|---|---|---|---|
动物组织 | 单个样品>0.1g,2mlEP管或冻存管装,不要过量;样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低,冻存样本避免反复冻融以致降解 | -80℃ | 干冰 | 所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识 |
种子样本 | 去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 | |
贴壁/悬浮细胞 | 1. 总RNA或蛋白:106cell/指标、浆/核RNA或蛋白:107cell/指标、线粒体RNA或蛋白:2*107 cell/指标,样本尽量新鲜,细胞收取后直接加Trizol(QPCR检测)或直接冻存于-80℃ 2. 若细胞处理(加药、转染、感染)后状态差应酌情加大收样量 | -80℃ | 干冰 | |
全血/血清样品 | 用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白细胞匀浆>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。 | -80℃ | 干冰 | |
石蜡包埋样品 | 由标准的石蜡包埋盒包埋的石蜡块,有效厚度大于 0.1cm; 新鲜的 FFPE 组织切片,每片厚度不超过 10μm,2~8 张,表面积不超过 250mm2。 | -20℃ | 冰袋 | |
抗体 | 1. 按样本种属提供满足相应实验要求的抗体; 2. 按抗体说明书要求寄送,尽量避免分装;如分装,确保量足够进行实验,并提供抗体说明书。 3.保存抗体的抗体管上应有能够识别此抗体的标记,抗体的量应大于实验所需的量。 | -20℃ | 冰袋 | |
引物 | 干粉,≥1OD,如进行预实验,每个基因至少提供两对引物, 附带公司引物合成单。 | -20℃ | 冰袋或常温 |