Chip-seq实验原理简图版
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
今天普拉特泽生物跟大家一起学习的是Chip-seq实验原理简图版
ChIP-seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的高通量测序技术。而普拉特泽生物——分子检测平台也非常重视这一点,为广大科研人员提供Chip实验外包服务,同时也绘制了各种chip实验流程图片,分享给大家一起共勉!
声明:以下图片绘制均来源网络~ChIP-seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)它通常用于研究转录因子、组蛋白修饰、染色质结构等与基因表达调控相关的生物学问题。
ChIP-seq的基本原理是:利用特定的抗体将感兴趣的蛋白质与DNA结合的复合物进行免疫共沉淀,然后通过高通量测序技术对免疫共沉淀的DNA进行测序和分析,以确定蛋白质与DNA结合的位置和数量。
具体步骤如下:
1.利用甲醛固定蛋白质和DNA
将细胞或组织样品与甲醛等交联剂进行交联,使得蛋白质与DNA之间形成稳定的交联复合物。
2.利用超声波/限制性酶切割DNA
将交联后的细胞或组织样品进行裂解,使得蛋白质-DNA复合物被释放出来。
3.免疫共沉淀
使用特定的抗体对感兴趣的蛋白质进行免疫共沉淀,将与蛋白质结合的DNA片段一同沉淀下来。
4.反交联
将免疫共沉淀的样品进行反交联,使得蛋白质与DNA之间的交联断开,同时将DNA片段从蛋白质中解离出来。
5.DNA纯化
将反交联后的DNA进行纯化和富集,去除杂质和不需要的DNA片段。
6.文库构建
将纯化后的DNA片段进行文库构建,包括DNA片段的修饰、适配体的连接、PCR扩增等步骤。
7.高通量测序
对构建好的文库进行高通量测序,得到大量的短读序列。
8.数据分析
对测序数据进行处理和分析,包括数据分析对测序数据进行处理和分析、序列比对、峰值识别、富集分析、差异分析等步骤,以及它们在基因表达调控中的功能和机制。
All in all,chip-seq技术的原理是通过免疫共沉淀和高通量测序技术,对蛋白质与DNA相互作用的复合物进行定位和分析,从而揭示基因表达调控的分子机制和生物学意义。
这是一项超适合转录因子研究的技术!!!
好,今天关于Chip-seq实验原理简图
就说到这里
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