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小白也能学会的细胞DNA提取步骤

2025-05-09 15:06:49

来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台

    大家好!今天普拉特泽生物继续跟大家一起学习新的实验——细胞DNA提取步骤。

首先我们看看原理——

    实验原理DNA是一种带有负电荷的高分子聚合物,在水中溶解度较高,但在异丙醇等有机溶剂中溶解度较低。当细胞裂解后,DNA在水相中溶解,而蛋白质和多糖等其他细胞成分则在有机相中溶解。异丙醇加入后,改变了溶液中水分子的排列,减少了水分子与DNA之间的氢键作用,使得DNA分子间的相互作用增强,从而促使DNA沉淀。另外,异丙醇还能引起蛋白质变性,通过破坏蛋白质的二级和三级结构,减少蛋白质与DNA之间的相互作用,使得DNA更容易从蛋白质中分离出来。异丙醇提取过程中,许多细胞内的多糖、脂质和蛋白质等杂质会留在水相中,而不与DNA一起沉淀,从而实现了DNA与这些杂质的分离。通过离心可以收集到含有DNA的沉淀,然后使用70%的乙醇进行洗涤,以去除残留的盐分和有机溶剂。最后,DNA沉淀被重悬于适当的缓冲液中,得到相对纯净的DNA样品。

2.试剂配制及原理

Tris(三羟甲基氨基甲烷):是一种常用的缓冲剂,能够维持溶液的pH值相对稳定。在细胞裂解过程中,Tris能够防止pH变化对酶活性的影响,保护细胞内的酶和蛋白质在裂解过程中不被破坏。EDTA(乙二胺四乙酸):是一种强力的金属离子螯合剂,能够与多种金属离子(如Ca2+、Mg2+、Fe2+等)形成稳定的复合物。在细胞裂解液中,EDTA可以去除这些金属离子,防止它们对酶活性的抑制或激活,以及避免金属离子催化的氧化反应损伤蛋白质和核酸。

另外,EDTA通过螯合金属离子,可以抑制一些需要金属离子作为辅因子的核酸酶的活性,从而保护DNA和RNA不被降解。SDS(十二烷基硫酸钠):是一种阴离子表面活性剂,能够破坏蛋白质的二级和三级结构,使蛋白质变性。同时它能够与蛋白质结合,形成SDS-蛋白质复合物,增加蛋白质在溶液中的溶解度,防止蛋白质沉淀。

3实验步骤 1、裂解细胞:当细胞汇合度≥60%时,即可提取细胞的DNA。先吸弃细胞培养基,加PBS清洗一遍,然后加入胰酶消化,消化完成后加1mL培养基把细胞吹打下来,将细胞悬液移至干净的15mL离心管中,1000rpm,3min离心,弃上清。加入5mL(1个3.5cm皿)细胞裂解液和50μL蛋白酶K(20mg/mL)吹散细胞。2、55℃过夜3、加入等体积的异丙醇(5mL),上下颠倒混匀,出现DNA沉淀,用枪头将DNA沉淀挑至新的Ep管中。(若DNA沉淀较少,则需要离心并弃上清)。4、加入1mL新鲜制备的70%的乙醇,上下颠倒10次以洗涤沉淀,离心,弃上清,把物质转移到新的Ep管中。5、空离Ep管,晾干。6、加入100μL ddH2O,65℃,1h,溶解DNA。7、检测DNA浓度,然后放-20℃保存。

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