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【科研专题】自噬研究全解析(二)想研究自噬流?这几种检测方法你得知道!

2025-04-28 13:50:16

来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台

    大家好!今天普拉特泽生物继续跟大家一起学习【科研专题】自噬研究全解析(二)。想研究自噬流?这几种检测方法你得知道!

自噬,这一细胞内高度保守的降解过程,就像细胞专属的 “清洁队”,能清除受损的蛋白质、细胞器,维持细胞内环境稳态,在发育、免疫和疾病发生发展等多个生理、病理过程中扮演关键角色。自噬流,描述的正是自噬发生过程中,自噬体形成、与溶酶体融合,以及底物降解的这一动态流程。检测自噬流,对理解自噬机制、疾病发生发展及寻找干预靶点至关重要。


检测自噬流的方法有多种,以下是一些常见的方法:


电镜观察自噬体的形成——自噬检测金标准

自噬体属于亚细胞结构,需要使用透射电子显微镜观察自噬体的形态。


电镜检测自噬主要是基于辨认自噬体结构特征


Western blot 检测自噬相关蛋白

LC3贯穿整个自噬过程,是目前公认的自噬标记物。利用WB检测LC3- 11/I比值的变化以评估自噬的强弱。LC3-I/II 的形成和降解是一个动态过程,瞬时LC3-I I表达不能反映自噬程度,需增加自噬的抑制剂、自噬的激动剂,正反证明自噬的发生。


p62作为自噬的重要受体,主要依赖于自噬途径进行降解。因此,P62的蛋白水平也常常用来指示自噬的降解情况。


LC3 双荧光标记法:观测自噬流的神器

mRFP-GFP-LC3 双荧光自噬指示体系让自噬研究更上一层楼!自噬流的顺畅对细胞生理功能至关重要哦!


这个方法是用同时带有 RFP 和 GFP 的病毒感染细胞。GFP 在酸性环境下会淬灭,而 mRFP 不受影响。当自噬发生时,会看到明亮的黄色荧光,这就是被红色荧光和绿色荧光同时标记的自噬体啦!当自噬体和溶酶体融合,pH 值降低,GFP 荧光淬灭,就只能看到红色荧光了呢!所以,GFP 的减弱表示自噬溶酶体形成顺利,GFP 越少,自噬小体到自噬溶酶体的流通就越顺畅。反之,融合被抑制,自噬溶酶体进程就受阻了哦!而 mRFP 一直稳定表达,通过 GFP 与 mRFP 的荧光比例就能评价自噬。


在研究自噬过程中,构建自噬双标稳株(如mRFP-GFP-LC3系统)需要配套的质粒、病毒和抗体工具。以下是普拉特泽生物针对自噬双标研究的全面推荐,涵盖质粒、病毒和抗体,帮助您高效开展实验。
常用的病毒工具推荐

(1)慢病毒(Lentivirus)


特点:高效感染多种细胞类型,可稳定整合到基因组中,适合构建稳定细胞系。


推荐病毒:

Lv-LC3B-oe(mCherry,GFP)慢病毒

Lv-LC3-oe(RFP,GFP)慢病毒


以上两种均可用于构建自噬双标稳株、监测自噬体形成。


(2)腺病毒(Adenovirus


特点:高感染效率,适合短期表达实验。


推荐病毒:

Adv-LC3B-oe(mCherry,GFP)腺病毒

Adv-LC3B-oe(RFP,GFP)腺病毒


(1)A549-mRFP-GFP-LC3B自噬双标稳株

(2)MCF-7-mCherry-GFP-LC3自噬双标稳株     

(3)SH-SY5Y-mCherry-GFP-LC3自噬双标稳株

以下是我们构建自噬双标稳株的案例分享:

质粒产品推荐


质粒是构建自噬双标稳株的基础工具,以下是常用的自噬相关质粒:
(1)mRFP-GFP-LC3质粒
用途:用于实时监测自噬流(autophagic flux)。GFP在酸性环境中淬灭,而mRFP稳定,因此可以区分自噬体(GFP+/mRFP+)和自噬溶酶体(mRFP+)。


推荐

ptfLC3(货号:BR124)

pCDH-CMV-mRFP-GFP-hLC3B-EF1A-Puro(丰晖货号:BR641)


(2)LC3相关质粒
用途:LC3是自噬的标志性蛋白,可用于研究自噬体的形成。

推荐:

pEGFP-LC3b(货号:BR161)

pmCherry-LC3a(货号:BR156)


(3)自噬相关基因过表达质粒
用途:研究特定基因对自噬的调控作用。

推荐:

pCMV-ATG5(货号:22952)     

pCMV-Beclin1(货号:24388)

pCMV-ULK1(货号:27631)


(4)自噬相关基因敲除质粒
用途:通过CRISPR/Cas9技术敲除自噬相关基因。

推荐:

lentiCRISPR v2(货号:BR521)

pSpCas9(BB)-2A-GFP(货号:BR080)


抗体产品推荐
抗体是验证自噬相关蛋白表达和功能的重要工具。以下是常用的自噬相关抗体:
(1)LC3抗体
用途:检测LC3-I和LC3-II的转化,评估自噬活性。

推荐抗体:

LC3B Polyclonal Antibody(货号:Fab8383)


(2)p62/SQSTM1抗体
用途:检测自噬底物的降解,评估自噬流。

推荐抗体:

SQSTM1/p62 rabbit pAb(货号:Fab14039)


(3)ATG5抗体
用途:检测ATG5蛋白表达,研究自噬体的形成。

推荐抗体:

ATG5 Rabbit Polyclonal Antibody(货号:Fab1156)


(5)ULK1抗体
用途:检测ULK1蛋白表达,研究自噬的起始。

推荐抗体:

ULK1 Polyclonal Antibody(货号:Fab15637)

关于以上相关产品都可以在普拉特泽生物官网:https://www.uptbio.com/

看完这些 “细胞清洁工” 的检测门道,你是否好奇:

自噬流紊乱究竟如何推动疾病进程?或是哪种方法最适合你的研究?

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