首页 > 技术文章 > ​实时荧光定量PCR实验技术答疑

​实时荧光定量PCR实验技术答疑

2022-07-28 13:55:45

来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台

    实时荧光定量PCR技术答疑由普拉特泽生物技术总结分享。实时荧光定量PCR是普拉特泽生物——表达检测平台的常规实验,本文主要根据普拉特泽生物承接的所有的荧光定量PCR实验特殊问题与进行实验技术咨询的同学常常提出的问题总结,分享给大家:

1实时荧光定量技术是什么?有什么用?

    实时荧光定量PCR技术(Real-time qPCR),其基本原理是在常规PCR基础上添加荧光染料或荧光染料探针,利用荧光信号积累实时监测整个PCR过程。荧光定量PCR最大的优势可以对初始模板进行定量,目前已广泛应用于生命科学、医学研究等领域。
2、CT值是什么?实验结果没有CT值怎么回事?

    在相对定量中,Ct值一般控制在15~25之间比较好,如果在绝对定量中,对低拷贝数的样品,Ct值会增大,但是一般不宜超过40循环,否则定量不准确。因此,判断Ct值出现过晚是否属于非正常情况,需要根据具体实验设计和目的进行。可能原因主要是:

    1)扩增效率低。引物之间或者引物和探针的比例不合适,需要进行优化;引物或探针设计不合理,需要重新设计;

    2PCR程序不合适,改用三步法进行反应,或者优化退火/延伸温度,可以适当降低退火温度;退火/延伸时间短(可以在推荐的时间条件下延长10s);

    3MgCl2浓度不合适,增加镁离子浓度等。PCR各种反应成分的降解或加样量的不足;

    4PCR产物太长。PCR产物设计超过500bp

    5)模板中存在抑制物。用高纯度模板进行PCR检测或将模板进行稀释。

3、我的荧光定量PCR结果标准曲线线性关系不佳怎么回事?

    如果遇到标准曲线线性关系不佳)的情况,那么很有可能是以下环节存在问题:

    1)标准品稀释或者加样存在误差,吸样不准,使得标准品不呈梯度;

    2)标准品出现降解。应避免标准品反复冻融,将高浓度DNA模板分装,保存于-20℃-80℃,不要反复冻融,现配现用;

    3)引物或探针不佳。重新设计更好更稳定的引物或探针;

    4)模板中存在抑制物。模板浓度过高,根据现有商品化荧光定量试剂盒的要求,一般模板量不超过500ng,以50~500ng为宜。

4、为什么我的阴性对照扩增有信号?

    如果阴性对照扩增有信号,首先排查各操作环节是否有不当,造成交叉污染:

    1)引物设计不够优化。应避免引物二聚体和发夹结构的出现。

    2)引物浓度不佳。适当降低引物浓度,并注意上下游引物的浓度配比。

    3)镁离子浓度过高。适当降低镁离子浓度,或选择更适合的mix试剂盒。

    4)模板有基因组的污染。RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异性扩增。

    5)交叉污染。在所用的试剂中有交叉污染,或操作环境中有气溶胶造成污染,建议对操作环境进行处理,或者更换新的环境、加样器、枪头以及所有的引物、试剂等。

5、为什么我的扩增曲线是S形的?

    如果遇到扩增曲线异常,很有可能是以下环节存在问题:

    1)模板的浓度太高或者降解;

    2)荧光染料的降解;

    3)在操作荧光定量PCR时,带上新的一次性手套,盖上避免任何指纹或者字迹等;

    4)液体挥发。耗材气密性等问题引起液体蒸发,没有很好的聚集在管子里;

    5)气泡。操作问题如移液枪加样引起的气泡问题。

    好啦,表达检测平台常常收到的技术咨询就是这么多啦,如果您关于荧光定量PCR还有其他的问题或者实验需要外包欢迎给客服留言,咱们一起学习共勉~