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EMSA实验详细操作步骤【新人干货】

2022-04-28 14:12:33

来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台

        EMSA实验详细操作步骤由普拉特泽生物旗下生物医学科研培训品牌——春风学院总结分享,快点学起来吧。普拉特泽生物自建3000平米生物实验室,专为科研人员提供真实专业的生物实验外包服务

        

        1、EMSA实验前准备

        1)合理的实验方案

        根据研究目的合理设计特异性探针实验组以及非特异性探针对照组,如有必要还可以添加特异性抗体组、特异性核酸竞争组等。

        2)样本制备

        可以选择提取样本的总蛋白、核蛋白或者使用纯化好的目的蛋白。对样本蛋白进行定量,实验中需等量加入蛋白。

        3)探针制备

        根据实验要求设计不同的探针并添加标记,可以合成核酸后自行添加,部分已知蛋白有商业化的抗体也可以直接购买。现在大多数实验室已经不再使用放射性标记,生物素使用相对较多。

        2、形成蛋白-探针复合物

        1)在0.5 mL离心管中按顺序将下列组份混匀:

        蛋白样本(2-5μg) XμL

        poly d(I-C) 1μL

        Binding Buffer 2μL

        Nuclease-Free ddH2O XμL

        总体积 9 μl

        2)冰浴5 min后,加入1 μ探针。(对照组加1ul对照探针)

        3)PCR仪中室温(20-23℃)温育30 min。

        3、制备凝胶,电泳

        1)制备6.5%非变性聚丙烯酰胺凝胶:(注意根据试剂情况按比例调整总体积)

        5XTBE 1 mL

        30%Acrylamide/Bis 2.2 mL

        deionized,sterilewater 6.62 mL

        80%Glycerol 80 μL

        10%AP 90 μL

        TEMED 10 μL

        总体积 10 mL

        2)按标准步骤制备凝胶。

        3)加样前先在预冷的0.5X TBE buffer中120V预电泳10 min,与电泳完毕后冲洗加样孔。

        4)混合样本及电泳缓冲液,点样电泳。

        5)将电泳槽置于冰上或者4℃环境中,恒压100V进行电泳,直至缓冲液指示带距离凝胶底部2~3 cm为止。(大约50-60 min,根据实际情况调整电泳时间及电压;电泳时间不宜过长)

        4、转膜

        1)在预冷的0.5XTBE中浸泡凝胶,膜,滤纸和纤维垫。

        2)按如下顺序组装“三明治”:纤维垫,滤纸,凝胶,膜,滤纸,纤维垫。注意电极,确保凝胶位于阴极、膜位于阳极。

        3)在预冷的0.5XTBE中进行转膜。转膜装置应置于冰上或者低温室中,恒压60V转膜1h。(注意根据实际情况调整电压及时间)。

        5、检测

        1)去除转好的膜,放入合适的盛有缓冲液的容器中,冲洗。(注意整个检测过程避免膜干燥)

        2)去掉冲洗缓冲液,加入封闭液后轻微震荡,室温封闭20 min。

        3)加入适量的HRP酶标记的链霉亲和素(Streptavidin-HRP conjugate),室温震荡孵育45 min。(勿将酶标记物直接加到膜上)

        4)去掉酶联物稀释液,用洗涤缓冲液洗膜三次,每次室温轻微震荡1 0 min。

        5)配置反应底物,均匀加至膜上,室温孵育5 min。(可以在加完底物后,用薄膜轻轻覆盖在膜上,使底物均匀覆盖,注意不要产生气泡)

        6)化学发光成像系统曝光成像(曝光时间的长短可以根据检测方法不同而进行相应调整)。
好啦,那关于EMSA凝胶迁移实验的详细操作步骤就写到这里啦,如果您还有其他的不懂可以留言和我们的技术小姐姐交流,更深入的学习哦!下期给大家讲讲EMSA实验操作过程中的注意事项,下期见!