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流式结果怎么看【干货文章】

2020-07-20 16:54:04

来源/作者:普拉特泽生物-医学整体课题外包

  我们首先来看看流式细胞术的简单介绍:

1、流式细胞术:是基于细胞或颗粒光学散射特点和荧光信号差异对单个细胞或颗粒进行统计分析的一种检测方法。

2、流式抗体:与普通抗体的不同,是偶联荧光素的抗体表达某一抗原的细胞与偶联荧光素的抗体特异性结合,经过流式细胞仪检测区时荧光素被激光激发,发射出的荧光信号被接收。分析时反推回去:某种荧光信号→某种流式抗体→某种抗原→某种细胞。

3、流式图:流式仪将接收到的光信号转化为电信号,经计算机转化为数字信号,绘制成图呈现。

既然流式结果都是以图片形式呈现的,那我们下面就重点来讲讲怎么看流式的结果图吧。

介绍图的类型

1. 直方图  2.散点图  3. 等高线图  4.密度图

1. 直方图Histograms)

a.横坐标代表荧光信号或散射光信号相对强度,可以是线性或对数坐标。

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b.纵坐标一般是相对细胞数。

直方图适用于分析处理周期(如下图)

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直方图分析数据注意事项:

① 不能比较不同标记之间的表达量。如一号样本单标记CD133、二号样本单标记CD44,那么CD133与CD44表达量不能用直方图进行比较。

② 直方图的形状(直方图的高度及宽度)取决于仪器的类型、处理软件和样本

③检测目的细胞非常少(即检测的细胞在一个细胞群体中所占的比例特别少),因此需要统计大量的数据,直方图将会将该稀有细胞覆盖,如下图散点图中的P2门为CD16阴性群体,但在直方图中则几乎看不出来,所以此时散点图为最佳展示数据方式。

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2. 散点图(Dot plots)

散点图是双变量图的基本图形,相对于单参数直方图其分析通量更高,同时也能更好观察到较小比例细胞群,参见直方图注意事项2,另外散点图中设门后,可以赋予门控颜色,便于观察门控细胞群在其他图中的分布,比如下图只赋予淋巴细胞门红色,则可以观察到淋巴细胞中在散射光图中的分布。

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横坐标和纵坐标都是光信号,十字门左下角是双阴性群,右下角和左上角是单阳群,右上角是双阳群。散点图上的每一个点可以代表某一个细胞的信息。

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但是散点图在显示足够多events下的细胞分群上缺乏细节,如下图,流式仪器记录的events达到50000以上时,CCR7的阳性群与阴性群已经没有明显界限,但当用等高线图或者密度图时,明显改善点图存在的缺点。

3. 密度图(Density plot)

密度图不仅能够表示一个标记的表达水平,还能显示给定区域中事件的相对数量(密度)。有三种密度图。密度度、斑马线图、伪彩图。选择自己一种喜欢的应用

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4.等高线图(Contour plots)

等高线图是另一显示数据密度的形式。该图使用等高线显示数据的相对强度。等高线的每条线包含events的百分比由所用软件的等高线图决定。单纯的等高线图不能显示低密度的群体颗粒或者异常值,最好的策略为等高线图与点图结合起来使用,比如下图左边为点图,中间为等高线图,右边为等高线加点图。

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分析,建议用散点图

用直方图不能说错,但这需要在没有自发荧光或自发荧光低、荧光渗漏调整到位的情况下。而在实际检测中,自发荧光总是难以避免,更不用说现在多色流式中荧光渗漏对通道的干扰。

摘录https://slideplayer.com/slide/13482960/中的图与大家剖析,通过下面这个图可以明显看出,在直方图上,自发荧光造成的拖尾,使得你的阴阳性分界位置难以确定,即使GFP样本能够形成双峰,但实际上双峰分界位置同时包括了自发荧光假阳性信号、阳性群弱表达信号,这两部分信号数量一样的时候,这个位置恰好相互抵消,但如果不一样的,这个比例就不准确了,如果改用下面的散点图,用不规则门(如下面的梯形门),就可以准确圈出阳性群,呈现更真实的比例:

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综上,不同类型的流式图各有优缺点,适用于不同类型的检测。这些流式图我们U平台的技术小哥哥都能做哟~老师有特定想要的图片类型可以跟我们要求,技术小哥哥也会根据您的检测内容推荐最好的图片形式的哦。