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PCR法检测支原体操作步骤

2021-07-09 15:49:52

来源/作者:普拉特泽生物-医学整体课题外包

以下文章转载自微信公众号 丰晖生物


首先在讲解检测支原体方法之前,我们先来了解一下:


什么是支原体?

支原体是细胞外生存的最小微生物,最小直径仅0.2μm,大小介于细菌和病毒之间,是一类缺乏细胞壁的原核细胞型微生物,呈高度多形性,有球形、杆形、丝状,分枝状等多种态。它不同于细菌,也不同于病毒,种类繁多,分布广泛,造成的危害相当大,涉及人、动物、植物及昆虫等多个领域,给人类健康和科研工作带来不利影响。从人体分离的16种支原体中,5种对人有致病性,即肺炎支原体、解脲支原体、人型支原体、生殖支原体及发酵支脲解支原体属含脲解支原体等体、脲解支原体及人型支原体等对人有致病性。由于支原体形态多变,在光境下不易看清内部结构。电镜下观察支原体膜为三层结构。其中央有电干密度大的密集颗粒群或丝状的中心束。支原体多吸附或散在于细胞表面和细胞之间,横断面与细胞微绒毛相似,但微绒毛电子密度比支原体小,且中央无颗粒群或中央束。


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实验目的

支原体因为个头小,能穿过0.22 μm滤器,并且在实验室内会潜在的扩散。支原体污染细胞后,培养液不一定会发生混浊。多数情况下细胞病理变化轻微或不显著,细微变化也可由于传代、换液而缓解,因此易被忽视。但个别严重者,可致细胞增殖缓慢,甚至从培养器皿脱落。所以支原体感染会使培养的细胞慢慢枯萎,使得用被污染的细胞样本做的实验完全失去意义和价值。因此,有必要对新引进的细胞和实验过程中的细胞株进行支原体检测。


实验原理

原核生物的rRNA碱基序列非常保守,而rRNA操纵子上编码rRNADNA间隔区如16 S和23 S间隔区,各种生物种间的碱基序列差别很大。这个间隔区的 DNA 序列在支原体各个种间既有相对保守的部分,也有具有很大差异的部分。因此我们针对编码 16 S23 S rRNADNA上设计一对F1/R1引物,扩增编码16 S23 S rRNADNA间隔区。此反应体系只特异性扩增支原体DNA,检出灵敏度与特异性都很高。



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本次介绍的PCR法检测支原体,具体操作方式详见下文:




一、实验样本和仪器试剂



实验样本:

用于检测支原体的样品是接种后进行 3-6 天细胞培养的培养上清液。如果使用常用的细胞培养基,培养上清可直接加入到 PCR 反应液中。如果使用细胞悬浊液作为样品,则需要提取 DNA,再进行 PCR 反应。


主要仪器与试剂:


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PCR


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电泳仪


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凝胶成像仪





二、方法

1.引物特异性展示

以下是NCBI引物特异性Blast部分结果。(点击图片放大 查看详细内容)


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7.png8.png9.png10.png



由此可见,该引物能检测绝大部分支原体,有良好的的特异性。


2.支原体检测引物

F:ACACCATGGGAGCTGGTAAT

R:CTTCTTCGACTTCCAGACCCAAGGCAT


3.实验步骤

(1)将合成的引物稀释成终浓度为100 nmol/L的储藏液与10 nmol/L的工作液。

(2)按以下组份配制PCR预混液:

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(3)向以上反应混合液中加入检测样品(5ul以下),使总体积达到50ul。添加样本时应防止交叉污染。

(4)把反应管放入PCR仪中,设定以下条件,进行PCR反应:


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PCR的检测下限是M. capricolum 1ng, M. hyopneumoniaeU. urealyticum 100pg、其他的Mycoplasma10pg。但是Human DNA、Mouse DNA100 ng时有非特异性片段扩增。

(5)预先配置好1~1.5%的琼脂糖胶,将完成的PCR反应液依次加入到胶孔中并选择合适的Marker进行琼脂糖凝胶电泳。



三、实验结果和数据

1.支原体检测结果

实验跑胶图如下:

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2.结论

经鉴定,样本1支原体检测结果为阴性。

经鉴定,样本2支原体检测结果为弱阳性。

经鉴定,样本3支原体检测结果为阳性。


好,以上就是今天关于“PCR法检测支原体”的实验技术全部内容了,你看懂了么?

如果有疑问可以留言噢~

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